69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3361 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  94.58 
 
 
738 aa  1420    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  100 
 
 
738 aa  1486    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  94.99 
 
 
738 aa  1426    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  94.99 
 
 
738 aa  1426    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  70.54 
 
 
722 aa  1043    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  69.92 
 
 
733 aa  1040    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  77.33 
 
 
727 aa  1157    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  71.55 
 
 
669 aa  1031    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  76.49 
 
 
775 aa  1153    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  76.78 
 
 
718 aa  1147    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  71.55 
 
 
669 aa  1031    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  92.01 
 
 
738 aa  1385    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  95.12 
 
 
738 aa  1430    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  99.04 
 
 
730 aa  1458    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  76.22 
 
 
722 aa  1146    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  67.78 
 
 
761 aa  988    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  68.29 
 
 
733 aa  1001    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  71.69 
 
 
669 aa  1032    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  46 
 
 
727 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  45.07 
 
 
729 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  45.17 
 
 
808 aa  598  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  37.74 
 
 
708 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  38.59 
 
 
743 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  34.35 
 
 
663 aa  362  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  25.83 
 
 
660 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  25.07 
 
 
640 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  24.8 
 
 
640 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  25 
 
 
640 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  24.84 
 
 
641 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  24.84 
 
 
641 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  24.38 
 
 
713 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  24.84 
 
 
641 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  24.51 
 
 
638 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  24.54 
 
 
640 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  24.08 
 
 
638 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  24.08 
 
 
638 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.9 
 
 
644 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.9 
 
 
644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  24.25 
 
 
638 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  25 
 
 
644 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  24.15 
 
 
630 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  24.15 
 
 
630 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  24.76 
 
 
644 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  24.24 
 
 
711 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  24.77 
 
 
644 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  23.46 
 
 
644 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  23.23 
 
 
638 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  24.1 
 
 
638 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.05 
 
 
644 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  23.61 
 
 
638 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  23.61 
 
 
638 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  23.61 
 
 
638 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  23.61 
 
 
638 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.18 
 
 
643 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  23.74 
 
 
638 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  23.74 
 
 
638 aa  104  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  23.01 
 
 
647 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  23.44 
 
 
638 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  23.05 
 
 
641 aa  99.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  23.05 
 
 
641 aa  99.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  23.05 
 
 
641 aa  99.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  23.05 
 
 
650 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  22.91 
 
 
650 aa  97.4  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  23.66 
 
 
523 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  23.73 
 
 
645 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  24.8 
 
 
1259 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3272  NHL repeat containing protein  21.99 
 
 
1095 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333117  normal  0.0421668 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.26 
 
 
343 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  23.44 
 
 
1342 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>