187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0295 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0295  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0304  CutA1 divalent ion tolerance protein  98.15 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0432895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3475  CutA1 divalent ion tolerance protein  92.59 
 
 
108 aa  209  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  84.26 
 
 
108 aa  192  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  83.33 
 
 
116 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  83.33 
 
 
116 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  83.33 
 
 
116 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  83.33 
 
 
116 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  83.33 
 
 
116 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  83.33 
 
 
108 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  83.33 
 
 
108 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0376  CutA1 divalent ion tolerance protein  93.52 
 
 
107 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2731  CutA1 divalent ion tolerance protein  92.59 
 
 
107 aa  182  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0355  CutA1 divalent ion tolerance protein  94.44 
 
 
108 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342416 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0277  CutA1 divalent ion tolerance protein  90.74 
 
 
108 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  69.81 
 
 
110 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3616  CutA1 divalent ion tolerance protein  69.81 
 
 
110 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00421644  hitchhiker  0.000000032142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0342  periplasmic cytochrome biogenesis protein  67.92 
 
 
106 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.66 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.55 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  43 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03922  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.38 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  50.5 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  45.71 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07401  CutA1 divalent ion tolerance protein  48.96 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  41 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1669  putative divalent cation tolerance protein  44.21 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.39 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.18 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.75 
 
 
105 aa  77  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  48.15 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2922  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.14 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.2 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0080  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  40.59 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  44.44 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  44.44 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  44.44 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  45.68 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.16 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0404  divalent-cation tolerance protein CutA  39.8 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607998  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.25 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.75 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.44 
 
 
114 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.59 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  45.68 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  39.58 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2717  CutA1 divalent ion tolerance protein  48 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.583537  normal  0.620046 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1690  periplasmic divalent cation tolerance protein  39 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0635803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.18 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.18 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1621  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.178296  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.18 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0665  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.54 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0689  putative divalent cation tolerance protein  40.21 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05051  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.38 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0443874  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.18 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.65 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.57 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.4 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.42 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.14 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.63 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.63 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.63 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.14 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04007  copper binding protein, copper sensitivity  36.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3855  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  38.14 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  38.61 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  40.74 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4720  divalent-cation tolerance protein CutA  37.76 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0186554  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4594  divalent-cation tolerance protein CutA  37.76 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.925297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4666  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4685  divalent-cation tolerance protein CutA  37.76 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4742  divalent-cation tolerance protein CutA  37.76 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.39 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03969  hypothetical protein  36.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3875  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5653  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  normal  0.759163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4606  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00265756  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4378  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.043112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4692  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4602  divalent-cation tolerance protein CutA  37.76 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.8 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.61 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0645  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.82 
 
 
109 aa  66.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23326  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.55 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0244  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.27 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00963425  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3265  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.05 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189693  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.64 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3521  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.4 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008345  Sfri_3665  CutA1 divalent ion tolerance protein  31 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0560029  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_0716  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.27 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.737655  normal  0.575155 
 
 
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