More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4560 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0587  aldehyde dehydrogenase family protein  81.85 
 
 
496 aa  808    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3165  Betaine-aldehyde dehydrogenase  68.67 
 
 
492 aa  700    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  89.52 
 
 
496 aa  920    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1328  aldehyde dehydrogenase family protein  81.85 
 
 
496 aa  808    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.74 
 
 
491 aa  688    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2502  aldehyde dehydrogenase family protein  82.26 
 
 
496 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  97.38 
 
 
496 aa  938    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4502  Aldehyde Dehydrogenase  70.47 
 
 
500 aa  691    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319143  normal  0.917567 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0980  aldehyde dehydrogenase family protein  81.85 
 
 
496 aa  808    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.340649  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1113  betaine-aldehyde dehydrogenase  97.18 
 
 
496 aa  939    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.016361  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  81.97 
 
 
488 aa  827    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4634  Aldehyde Dehydrogenase  70.47 
 
 
500 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20636  normal  0.0898533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3685  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.12 
 
 
495 aa  681    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  87.07 
 
 
498 aa  890    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
496 aa  1009    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  90.32 
 
 
499 aa  924    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0311  aldehyde dehydrogenase family protein  81.85 
 
 
496 aa  808    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0753946  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1242  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  82.26 
 
 
496 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3666  betaine-aldehyde dehydrogenase  96.98 
 
 
496 aa  932    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0960  aldehyde dehydrogenase  68.94 
 
 
491 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1315  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  82.26 
 
 
496 aa  811    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.953752  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3992  betaine-aldehyde dehydrogenase  94.35 
 
 
496 aa  915    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254336  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4095  betaine-aldehyde dehydrogenase  99.19 
 
 
496 aa  1000    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  96.98 
 
 
496 aa  932    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3957  aldehyde dehydrogenase  63.02 
 
 
489 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0142  aldehyde dehydrogenase  62.6 
 
 
489 aa  590  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0825  aldehyde dehydrogenase  58.93 
 
 
499 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4111  Aldehyde Dehydrogenase  56.76 
 
 
516 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.94 
 
 
492 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4430  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  56.65 
 
 
496 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81725  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0181  aldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 
478 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2088  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.68 
 
 
483 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214438  normal  0.175719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.47 
 
 
493 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  45.44 
 
 
493 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  45.44 
 
 
493 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.7 
 
 
498 aa  415  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
490 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
512 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.02 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  44.4 
 
 
493 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.19 
 
 
498 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  42.98 
 
 
473 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
496 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 
493 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  41.67 
 
 
502 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.15 
 
 
482 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
503 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
494 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
489 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
494 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  41.79 
 
 
491 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.58 
 
 
494 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
483 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.8 
 
 
494 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  42.2 
 
 
503 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
494 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
494 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
494 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  41.82 
 
 
494 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.65 
 
 
490 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
494 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.58 
 
 
494 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.67 
 
 
497 aa  383  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  43.04 
 
 
497 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  43.01 
 
 
478 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
490 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  42.2 
 
 
499 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  45.61 
 
 
495 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  41.86 
 
 
490 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.72 
 
 
483 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  39.34 
 
 
488 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.32 
 
 
493 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5033  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
507 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  38.72 
 
 
488 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
490 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  42.02 
 
 
505 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
492 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
491 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4650  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
507 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
492 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.42 
 
 
496 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.6 
 
 
494 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4738  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
507 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  44.13 
 
 
504 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
494 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3524  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
505 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00723314  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.95 
 
 
503 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  40.87 
 
 
510 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1177  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.49 
 
 
488 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.585771  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
507 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.8 
 
 
490 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1244  Aldehyde Dehydrogenase  40.59 
 
 
490 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00471898  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 
483 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 
497 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.21 
 
 
493 aa  365  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>