46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1426 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  96.65 
 
 
418 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  89.93 
 
 
418 aa  757    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  88.97 
 
 
418 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  89.93 
 
 
418 aa  757    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  88.73 
 
 
418 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  96.65 
 
 
418 aa  783    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  100 
 
 
418 aa  857    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  96.65 
 
 
418 aa  783    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  96.65 
 
 
418 aa  783    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  91.13 
 
 
418 aa  764    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  96.65 
 
 
418 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  96.65 
 
 
418 aa  783    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  96.65 
 
 
418 aa  783    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  89.93 
 
 
418 aa  757    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  62.92 
 
 
418 aa  551  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  53.8 
 
 
408 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  53.15 
 
 
398 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  52.6 
 
 
398 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  49.4 
 
 
404 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  48.09 
 
 
405 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  52.32 
 
 
404 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0110  bicupin, oxalate decarboxylase family  48.53 
 
 
402 aa  352  5e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  47.58 
 
 
384 aa  344  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  47.45 
 
 
378 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  47.85 
 
 
658 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  41.28 
 
 
477 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  44.81 
 
 
389 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  40.96 
 
 
407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  34.4 
 
 
389 aa  226  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  48.08 
 
 
234 aa  202  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  27.94 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4437  cupin domain-containing protein  29.27 
 
 
271 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2283  Cupin domain protein  22.03 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000254412  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1577  hypothetical protein  29.25 
 
 
224 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000455455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1792  hypothetical protein  29.25 
 
 
211 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1873  hypothetical protein  26.42 
 
 
211 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1819  hypothetical protein  26.42 
 
 
211 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  34.31 
 
 
150 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1617  cupin domain-containing protein  27.04 
 
 
211 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1742  hypothetical protein  29.25 
 
 
211 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.614023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1568  hypothetical protein  29.25 
 
 
211 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1616  hypothetical protein  29.25 
 
 
211 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.751864  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 
146 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  23.81 
 
 
372 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  27.55 
 
 
112 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  31.25 
 
 
156 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>