19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0924 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0924  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  43.96 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  47.76 
 
 
179 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  33.7 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  34.44 
 
 
162 aa  52.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  33.7 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  33.7 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  33.7 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  33.7 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  39.13 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  32.86 
 
 
347 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  37.78 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  33.33 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  34.85 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  34.85 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  40.91 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  31.11 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00139  endolysin  40.3 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>