25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1126 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1126  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  224  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1032  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  224  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4180  type IV pilus assembly PilZ  78.38 
 
 		 111 aa  154  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0057  type IV pilus assembly PilZ  33.7 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  41.1 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  33.01 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2285  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  39.24 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  28.4 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  35 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  32.04 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  32.97 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  31.82 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  35 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  34.12 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  34.44 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  39.13 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  32.14 
 
 		 81 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  34.57 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  33.73 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  31.67 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>