186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1038 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  190  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  81.52 
 
 		 98 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  56.38 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3490  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.56 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4258  excinuclease ABC subunit C  52.13 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00754458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3649  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.84 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.61 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.81 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3525  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.76 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.506874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  56.32 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3325  excinuclease ABC subunit C  51.76 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.369654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  47.78 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  47.78 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  48.1 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  52 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  48.68 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3763  excinuclease ABC subunit C  44.32 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  48.68 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  48.68 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4363  excinuclease ABC, C subunit-like protein  44.44 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.84 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.05 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.67 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  49.35 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.74 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.45 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  45.33 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.79 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.45 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  39.33 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.42 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.83 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  44.74 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  44.74 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.93 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.51 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  41.33 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1608  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.74 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  41.77 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  40.45 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.04 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  45.35 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  41.89 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  41.56 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.33 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  42.67 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.96 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.33 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.77 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  40.54 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.16 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.33 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  37.97 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  33.77 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  34.94 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  40.79 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.48 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.73 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.73 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  34.44 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  36.71 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  37 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  36.62 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  36 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.57 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  36.71 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  43.84 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.16 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.84 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.84 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  42.65 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  42.65 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  42.65 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>