22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0640 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0640  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  435  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0635  hypothetical protein  99.53 
 
 
213 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2644  hypothetical protein  56.19 
 
 
211 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  31.47 
 
 
464 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  27.51 
 
 
729 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  32.8 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  28.71 
 
 
464 aa  75.1  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  27.65 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  28.8 
 
 
464 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  31.5 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  28.78 
 
 
463 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  28.78 
 
 
463 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3511  hypothetical protein  27.27 
 
 
668 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.789255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3187  hypothetical protein  27.75 
 
 
669 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0701  hypothetical protein  29.41 
 
 
630 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127075  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.57 
 
 
707 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1480  OmpA/MotB domain protein  26.34 
 
 
612 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172439  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1903  hypothetical protein  31.19 
 
 
684 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3382  hypothetical protein  25.99 
 
 
670 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  27.16 
 
 
652 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  27.16 
 
 
652 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  25.88 
 
 
617 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>