68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0912 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  100 
 
 
574 aa  1167    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.98 
 
 
605 aa  213  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  28.74 
 
 
507 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  26.2 
 
 
531 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.58 
 
 
155 aa  90.9  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.51 
 
 
206 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.69 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.57 
 
 
177 aa  84  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.13 
 
 
413 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.21 
 
 
170 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.07 
 
 
257 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.27 
 
 
171 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.77 
 
 
171 aa  77  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.8 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.53 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.85 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.57 
 
 
481 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.82 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.06 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.12 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.52 
 
 
866 aa  61.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.45 
 
 
498 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1160  hypothetical protein  36.26 
 
 
350 aa  59.3  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.74704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.27 
 
 
628 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0726  hypothetical protein  28.89 
 
 
210 aa  56.6  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2208  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  20.88 
 
 
552 aa  54.3  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.827056  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.33 
 
 
250 aa  53.5  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  30.9 
 
 
190 aa  53.5  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  22.53 
 
 
492 aa  53.5  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2863  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.83 
 
 
339 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.772314  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.43 
 
 
218 aa  53.5  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.44 
 
 
541 aa  52.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.914763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  25.19 
 
 
636 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.29 
 
 
272 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.28 
 
 
253 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.55 
 
 
142 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.56 
 
 
253 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.14 
 
 
386 aa  50.4  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0095  hypothetical protein  30.77 
 
 
143 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  25.64 
 
 
253 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1758  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.72 
 
 
400 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.83 
 
 
235 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.14 
 
 
386 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.53 
 
 
253 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.64 
 
 
253 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  24.3 
 
 
520 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  25.64 
 
 
253 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  25.64 
 
 
253 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 
307 aa  48.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.17 
 
 
247 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.82 
 
 
236 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.33 
 
 
415 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3256  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.34 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  32.35 
 
 
636 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.29 
 
 
326 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.94 
 
 
261 aa  45.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.12 
 
 
300 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
303 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1326  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.71 
 
 
177 aa  45.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  24.13 
 
 
670 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.24 
 
 
257 aa  44.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1021  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.11 
 
 
417 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  normal  0.540486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5256  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.36 
 
 
524 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210473  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8817  hypothetical protein  26.12 
 
 
276 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.432511  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  25.1 
 
 
518 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1745  hypothetical protein  28.45 
 
 
187 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0385777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0479  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.74 
 
 
323 aa  43.5  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.035674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>