More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0394 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 220 aa  455  1e-127  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  79.53 
 
 		 222 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  78.34 
 
 		 220 aa  329  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  78.34 
 
 		 220 aa  329  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  78.34 
 
 		 220 aa  329  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  76.96 
 
 		 221 aa  326  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  75.69 
 
 		 222 aa  322  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  75.69 
 
 		 222 aa  322  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  76.15 
 
 		 222 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  76.15 
 
 		 222 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  76.15 
 
 		 222 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  75.69 
 
 		 222 aa  322  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  75.69 
 
 		 222 aa  322  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  75.69 
 
 		 222 aa  322  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  76.15 
 
 		 222 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  75.69 
 
 		 222 aa  322  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  75.69 
 
 		 222 aa  322  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  75.69 
 
 		 222 aa  322  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  76.15 
 
 		 222 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  75.69 
 
 		 222 aa  322  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  75.23 
 
 		 222 aa  319  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  77.67 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  76.5 
 
 		 220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  76.5 
 
 		 220 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  66.67 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  62.15 
 
 		 217 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  62.15 
 
 		 217 aa  281  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  62.79 
 
 		 230 aa  278  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  66.2 
 
 		 219 aa  276  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  62.74 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  62.74 
 
 		 227 aa  275  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  64.32 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  65.57 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  65.57 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  65.57 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  65.57 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  66.04 
 
 		 214 aa  271  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  65.09 
 
 		 214 aa  269  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  65.09 
 
 		 216 aa  268  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  64.62 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  64.62 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  64.62 
 
 		 216 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  64.15 
 
 		 216 aa  265  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  62.5 
 
 		 216 aa  261  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  64.79 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  59.62 
 
 		 227 aa  255  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  63.59 
 
 		 217 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  52.15 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  54.14 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  53.07 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  48.5 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  48.6 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  41.8 
 
 		 270 aa  134  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  42.78 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  40.44 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  43.41 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  44.97 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  54.47 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  42.08 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  42.08 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  44.51 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  52.42 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  46.34 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  40.66 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  41.76 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  40.43 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  40.35 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  53.28 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  40.11 
 
 		 188 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  41.27 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  41.18 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  40.66 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1665  GTP cyclohydrolase  41.21 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.109192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  38.59 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  41.94 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  41.21 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  40.88 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  40.53 
 
 		 190 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  39.34 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  37.43 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  40.21 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  40.21 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  40.57 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  39.78 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  38.38 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  39.89 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  40.76 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  34.74 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  51.61 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  40.22 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  49.6 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  49.6 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  38.83 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  38.83 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  40.66 
 
 		 202 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  40.53 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>