39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A5484 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5484  RNA polymerase sigma-70 factor  100 
 
 		 59 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5466  RNA polymerase sigma factor  96.15 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.589773 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5044  RNA polymerase sigma factor  94.23 
 
 		 176 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5492  RNA polymerase sigma factor  89.29 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5212  RNA polymerase sigma factor  94.23 
 
 		 175 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5060  RNA polymerase sigma factor  94.23 
 
 		 177 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5610  RNA polymerase sigma factor  94.23 
 
 		 175 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5541  RNA polymerase sigma factor  94.23 
 
 		 177 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5454  RNA polymerase sigma factor  94.23 
 
 		 175 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1894  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.78 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4155  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.54 
 
 		 203 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00426853  hitchhiker  0.000149569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1006  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.64 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1295  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  48.78 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0754844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1470  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  50 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4008  RNA polymerase sigma factor SigE  43.59 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.290369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2200  RNA polymerase sigma factor SigE  43.59 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11245  RNA polymerase sigma factor SigE  43.59 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00634169  normal  0.0158718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1857  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  43.59 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3994  RNA polymerase sigma factor SigE  43.59 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.622546  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0154  RNA polymerase sigma factor SigW  37.5 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000564665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4496  RNA polymerase sigma factor SigE  43.59 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11684  normal  0.283711 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4068  RNA polymerase sigma factor SigE  43.59 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0887025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1133  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  41.46 
 
 		 195 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2923  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  41.3 
 
 		 240 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0150  RNA polymerase sigma factor SigW  41.67 
 
 		 190 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0089  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.5 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0504  RNA polymerase sigma factor SigE  41.03 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.221643  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2156  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  43.59 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144154  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3891  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.03 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.611109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1212  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.21 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000198211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2126  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.21 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  0.031897 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05470  RNA polymerase factor sigma-70  31.58 
 
 		 315 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1123  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.36 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1826  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.9 
 
 		 235 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.184258  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2921  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.03 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3887  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  43.9 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.526394  normal  0.0354938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1210  RNA polymerase sigma factor SigE  35.9 
 
 		 230 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.380405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4749  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.46 
 
 		 204 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1067  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.03 
 
 		 215 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>