More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7251 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7251  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 
292 aa  591  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0312238  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  35.52 
 
 
289 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28290  rhodanese-related sulfurtransferase  38.85 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  36.58 
 
 
288 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0454  Rhodanese domain protein  40.07 
 
 
298 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  34.97 
 
 
291 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  36.64 
 
 
282 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.64 
 
 
282 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  36.95 
 
 
286 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.81 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 
281 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.59 
 
 
283 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  37.41 
 
 
284 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.21 
 
 
285 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  35.62 
 
 
282 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
283 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  36.27 
 
 
290 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  35.47 
 
 
284 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  33.79 
 
 
289 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.47 
 
 
316 aa  135  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.24 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.1 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.46 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.9 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  31.69 
 
 
276 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.46 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.93 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.33 
 
 
292 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 
283 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  31.62 
 
 
288 aa  132  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  31.88 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.88 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  33.92 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  33.56 
 
 
278 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  34.24 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  34.68 
 
 
285 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  35.03 
 
 
312 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 
281 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  32.09 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
289 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.56 
 
 
285 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  32.32 
 
 
282 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  34.81 
 
 
282 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 
286 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  34.34 
 
 
284 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.45 
 
 
285 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.22 
 
 
292 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  34.01 
 
 
282 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  34.8 
 
 
282 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 
278 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  31.6 
 
 
291 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  33.22 
 
 
477 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  34.25 
 
 
292 aa  122  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.38 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  28.28 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  28.28 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.87 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  30.51 
 
 
277 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
284 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  28.62 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  34.35 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  31.94 
 
 
302 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.67 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  31.67 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.67 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.67 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.67 
 
 
281 aa  118  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.67 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.79 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.78 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  31.67 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  28.28 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  33 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.32 
 
 
281 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
289 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
289 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
289 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.25 
 
 
289 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
289 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
289 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.25 
 
 
289 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.32 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  36.33 
 
 
296 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 
289 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  29.97 
 
 
285 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  29.33 
 
 
289 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.27 
 
 
289 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 
283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.69 
 
 
289 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.09 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.67 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  31.9 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  29.11 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>