44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4097 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4097  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0235678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3981  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.96 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00418291  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.41 
 
 
192 aa  108  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4489  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.8 
 
 
224 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5002  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
224 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2124  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.22 
 
 
224 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.39 
 
 
118 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.58 
 
 
109 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.01 
 
 
114 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.01 
 
 
114 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  44.79 
 
 
120 aa  84.7  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  44.79 
 
 
120 aa  84.7  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.54 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.54 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  41.94 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.01 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.01 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.01 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
149 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
461 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.54 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.76 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.94 
 
 
129 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.21 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
107 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
116 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
116 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  35.48 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.01 
 
 
128 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.73 
 
 
107 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.73 
 
 
107 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 
107 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 
107 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 
107 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  34.69 
 
 
107 aa  61.6  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 
106 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  35.94 
 
 
84 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.73 
 
 
106 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>