40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3125 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  241  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  46.24 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  53.03 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  41.96 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  41.96 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  52.71 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  48.65 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  52.17 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  41.18 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  42.06 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  37.82 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  50.72 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  53.03 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  44.3 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  42.03 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  51.97 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  51.52 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  36.84 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  49.61 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  36.84 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  38.1 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  35.79 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  34.92 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  53.23 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  34.78 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  36.9 
 
 		 221 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  43.48 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  35.71 
 
 		 221 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  41.75 
 
 		 225 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  47.54 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  40.74 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  42.65 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1254  hypothetical protein  54.35 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0464649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  46.3 
 
 		 466 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  45.9 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  44.26 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  34.38 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  33.82 
 
 		 245 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>