65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1353 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1353  putative high affinity nickel transporter  100 
 
 		 406 aa  788    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.85251  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  64.36 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  66.49 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0860  high-affinity nickel-transporter  60.46 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0942  high-affinity nickel-transporter  61.04 
 
 		 384 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0338054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2905  high-affinity nickel-transporter  46.85 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0081  high-affinity nickel-transporter  38.4 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.940198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  38.46 
 
 		 359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4249  high-affinity nickel-transporter  35.55 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0096  hypothetical protein  34.66 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0088  hypothetical protein  34.66 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3692  high-affinity nickel-transporter  34.42 
 
 		 358 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  35.85 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3811  hypothetical protein  32.79 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1782  high-affinity nickel-transporter  39.33 
 
 		 346 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0391  high-affinity nickel-transporter  56.46 
 
 		 342 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  32.08 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1234  high-affinity nickel-transporter  29.48 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3041  high-affinity nickel-transporter  27.91 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.167253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  40.99 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  30.14 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1398  high-affinity nickel-transporter  51.7 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0677472  normal  0.0633291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1678  high-affinity nickel-transporter  44.33 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0510109  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  27.44 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2245  high-affinity nickel-transporter  46.94 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1403  high-affinity nickel-transporter  50.34 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198577  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3208  high-affinity nickel-transporter  31.32 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3031  high-affinity nickel-transporter  28.25 
 
 		 326 aa  97.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0277  high-affinity nickel-transporter  48.41 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2333  high-affinity nickel-transporter  44.79 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144614  normal  0.152273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  37.59 
 
 		 340 aa  93.6  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  37.59 
 
 		 340 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  37.59 
 
 		 340 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1079  permease  25 
 
 		 335 aa  93.6  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0887396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  27.56 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1753  high-affinity nickel-transporter  31.41 
 
 		 329 aa  89.7  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  27.21 
 
 		 328 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  27.21 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  42.27 
 
 		 340 aa  89  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  27.5 
 
 		 328 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  26.86 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  27.71 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2976  high-affinity nickel-transporter  35.59 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1976  putative nickel transporter  34 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0753  high-affinity nickel-transporter  37.96 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000315045  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1929  high-affinity nickel-transporter  39.06 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  32.54 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  37.84 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  36.22 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  36.05 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1737  high-affinity nickel-transporter  36.36 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  28.41 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  33.07 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0285  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  30.99 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0371568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  21.52 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 759 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 759 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  34.78 
 
 		 247 aa  53.5  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  32.33 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3677  high-affinity nickel-transporter  38.98 
 
 		 207 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.841534  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1792  tRNA pseudouridine synthase B  29.81 
 
 		 497 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  39.34 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  27.95 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.31 
 
 		 564 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  22.34 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>