218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0911 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0911  putative flagellar basal-body rod protein (flgC)  100 
 
 
125 aa  250  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0677  putative flagellar basal-body rod protein flgC  68.03 
 
 
136 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.652434  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0124  putative flagellar basal-body rod protein flgC  61.48 
 
 
136 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  59.2 
 
 
136 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.12 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  32.12 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.97 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.61 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  32.54 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  29.31 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1357  flagellar basal body rod protein FlgC  29.84 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  32.56 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  31.75 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  33.91 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  33.91 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  33.91 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  33.91 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  33.91 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  32.58 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.26 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3793  flagellar basal body rod protein FlgC  30.95 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  35.77 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  32.58 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1561  flagellar basal body rod protein FlgC  26.61 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  30.43 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  32.56 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  32.56 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  28.89 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0141  flagellar basal body rod protein FlgC  30.95 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  32.56 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  32.56 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  32.56 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  32.56 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  32.56 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.14 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  32.58 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  32.79 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  32.5 
 
 
141 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3467  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.01 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  29.32 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.86 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1710  flagellar basal body rod protein FlgC  26.92 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.2 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.23 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  33.33 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  34.21 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  34.19 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  32.8 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  34.21 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3970  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.84 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  34.19 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  34.21 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  28.35 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  34.21 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  34.21 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1820  flagellar basal body rod protein FlgC  28.21 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1764  flagellar basal body rod protein FlgC  28.21 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  30.58 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.15 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.15 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3635  flagellar basal body rod protein FlgC  26.15 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.37 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.35 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1558  flagellar basal body rod protein FlgC  27.35 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1532  flagellar basal body rod protein FlgC  27.35 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.123411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1521  flagellar basal body rod protein FlgC  27.35 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  26.27 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  27.56 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.31 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1675  flagellar basal body rod protein FlgC  27.35 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  28.35 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0051  putative flagellar basal body rod protein FlgC  39.62 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.4 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1742  flagellar basal body rod protein FlgC  27.35 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04910  flagellar basal body rod protein FlgC  30.33 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.89 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.46 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  32.56 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  26.98 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  29.31 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  28.79 
 
 
147 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  28.57 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.73 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  31.25 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  42.55 
 
 
266 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  25.64 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>