24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0640 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  40.79 
 
 		 268 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  40.27 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5183  proline hydroxylase-like protein  33.48 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000154624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  41.4 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44522  predicted protein  33.63 
 
 		 352 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5796  hypothetical protein  27.86 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  29.01 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0773  hypothetical protein  28.19 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0059  hypothetical protein  26.61 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382992  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  30.97 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  31.55 
 
 		 299 aa  98.6  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  28.99 
 
 		 309 aa  96.3  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3002  hypothetical protein  33.52 
 
 		 203 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2245  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.63 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  28.4 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  26.9 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07554  oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14810)  29.05 
 
 		 663 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  hitchhiker  0.00734337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  35.06 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  36.49 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12896  GrpE protein, HSP90 cofactor, chloroplast targeted  32.17 
 
 		 525 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  36.59 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  24.24 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4036  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  20.09 
 
 		 224 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.578065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>