More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0597 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0597  amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
240 aa  475  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0884053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3594  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  55.74 
 
 
239 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2178  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.74 
 
 
239 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142027  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2322  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.22 
 
 
239 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893058  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.74 
 
 
239 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309944  normal  0.926456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.61 
 
 
268 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142141  normal  0.98078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.74 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28022  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2065  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  44.49 
 
 
267 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  44.35 
 
 
240 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.91 
 
 
240 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.29 
 
 
237 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.25 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.36 
 
 
229 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7240  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  36.91 
 
 
256 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0593694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1654  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.56 
 
 
246 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.571683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1022  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.55 
 
 
238 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.563398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00867  arginine transporter subunit  37.55 
 
 
238 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.202852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2780  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.55 
 
 
238 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0935  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.55 
 
 
238 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00873  hypothetical protein  37.55 
 
 
238 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.202246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2734  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.55 
 
 
238 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586836  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0890  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.55 
 
 
238 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0966  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.55 
 
 
238 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2469  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.81 
 
 
238 aa  158  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.391563  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2627  arginine transporter permease subunit ArtQ  36.2 
 
 
238 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0961  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.36 
 
 
238 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0993  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.36 
 
 
238 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1024  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.36 
 
 
238 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0926  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.36 
 
 
238 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2712  arginine transporter permease subunit ArtQ  36.2 
 
 
238 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1043  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.36 
 
 
238 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1378  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.73 
 
 
238 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1581  arginine transporter permease subunit ArtQ  36.2 
 
 
238 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3519  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.91 
 
 
240 aa  154  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405389  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  36.78 
 
 
244 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  38.53 
 
 
244 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5101  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.19 
 
 
240 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381438  decreased coverage  0.00220155 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0592  arginine ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0258675  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1593  arginine transport system permease protein  41.18 
 
 
221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  37.38 
 
 
229 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3872  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.65 
 
 
238 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0253  arginine transporter permease subunit ArtQ  41.67 
 
 
223 aa  151  8e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00505088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
229 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
229 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.32 
 
 
229 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.32 
 
 
229 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.32 
 
 
229 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.22 
 
 
238 aa  148  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1828  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.04 
 
 
240 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300709  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003971  arginine/ornithine ABC transporter permease protein AotQ  35.56 
 
 
246 aa  148  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  36.92 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2494  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  37.85 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174518  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.07 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2582  histidine ABC transporter permease HisQ  37.38 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2540  histidine ABC transporter permease protein HisQ  37.38 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.512507  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2703  histidine ABC transporter permease HisQ  37.38 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2594  histidine ABC transporter permease HisQ  37.38 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1377  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.44 
 
 
229 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.11 
 
 
230 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1700  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.26 
 
 
238 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 
229 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1959  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  36.51 
 
 
246 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.450154  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.45 
 
 
229 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4835  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.17 
 
 
240 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.137601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3448  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  35.51 
 
 
228 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  34.73 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1966  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.39 
 
 
238 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02233  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  35.51 
 
 
228 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1348  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.51 
 
 
228 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2602  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  35.51 
 
 
228 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.311053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2458  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  35.51 
 
 
228 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2464  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  35.51 
 
 
228 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.51 
 
 
228 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.917469  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02193  hypothetical protein  35.51 
 
 
228 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7394  ABC transporter membrane spanning protein  33.05 
 
 
240 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1093  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.32 
 
 
229 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436853  normal  0.0653327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2686  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  35.51 
 
 
228 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3875  amino acid ABC transporter permease  34.75 
 
 
242 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2252  amino acid ABC transporter permease  38.17 
 
 
232 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05530  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.8 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2789  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5839  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.33 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.11 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2857  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.224945  normal  0.227891 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0352  histidine transport system permease HisQ  35.43 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.63 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001574  arginine ABC transporter permease protein ArtQ  39.3 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.552599  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1429  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  35.43 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0521843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3309  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1209  amino acid ABC transporter permease  37.44 
 
 
242 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5622  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.9 
 
 
240 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129998  normal  0.660092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4137  amino acid ABC transporter, permease protein  33.62 
 
 
237 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2651  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.91 
 
 
240 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0430594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 
232 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6596  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.47 
 
 
240 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20911 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5921  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.3 
 
 
241 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610786  normal  0.165756 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5750  amino acid ABC transporter permease  31.47 
 
 
240 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.47 
 
 
240 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1257  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.31 
 
 
240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1453  amino acid ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>