107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27530 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_27530  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  336  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2461  hypothetical protein  76.22 
 
 
164 aa  268  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248584  hitchhiker  0.00666738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2729  hypothetical protein  76.22 
 
 
164 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1977  hypothetical protein  73.17 
 
 
164 aa  260  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0622513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3113  hypothetical protein  73.17 
 
 
164 aa  260  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.300238  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2370  hypothetical protein  73.17 
 
 
164 aa  259  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.741209  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3325  hypothetical protein  73.17 
 
 
164 aa  259  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1883  hypothetical protein  71.95 
 
 
164 aa  257  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2146  hypothetical protein  71.95 
 
 
165 aa  254  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0124089  normal  0.436293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40780  hypothetical protein  72.56 
 
 
165 aa  248  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3458  hypothetical protein  71.95 
 
 
165 aa  245  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2479  hypothetical protein  51.46 
 
 
180 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1863  hypothetical protein  50.87 
 
 
179 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2474  hypothetical protein  50.87 
 
 
179 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0820  hypothetical protein  50.87 
 
 
185 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2523  hypothetical protein  50.88 
 
 
184 aa  163  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0815  hypothetical protein  51.5 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2391  hypothetical protein  50.29 
 
 
182 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5805  hypothetical protein  49.71 
 
 
180 aa  160  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0376383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3663  hypothetical protein  47.65 
 
 
179 aa  158  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0971  hypothetical protein  47.37 
 
 
179 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0664  hypothetical protein  50.6 
 
 
180 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1167  hypothetical protein  50.6 
 
 
180 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2347  hypothetical protein  50.6 
 
 
180 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2938  hypothetical protein  50.6 
 
 
180 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1014  hypothetical protein  50.6 
 
 
180 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1661  hypothetical protein  50.6 
 
 
180 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1007  hypothetical protein  50.6 
 
 
180 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2234  hypothetical protein  47.95 
 
 
181 aa  154  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893555  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2913  hypothetical protein  47.02 
 
 
169 aa  147  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2424  hypothetical protein  45.45 
 
 
194 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2228  hypothetical protein  46.02 
 
 
181 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2688  hypothetical protein  47.49 
 
 
182 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0797  hypothetical protein  43.53 
 
 
184 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2815  hypothetical protein  43.9 
 
 
191 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1529  hypothetical protein  44.17 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00088632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2060  hypothetical protein  44.38 
 
 
161 aa  134  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2695  hypothetical protein  39.88 
 
 
191 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1672  hypothetical protein  50 
 
 
208 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.162015  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1892  hypothetical protein  47.88 
 
 
165 aa  130  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2514  hypothetical protein  45.86 
 
 
159 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.525343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2014  hypothetical protein  41.07 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.320985  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3155  hypothetical protein  42.67 
 
 
165 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0963  hypothetical protein  54.87 
 
 
162 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10560  hypothetical protein  54.87 
 
 
162 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0888  hypothetical protein  41.46 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.20406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3266  hypothetical protein  42.94 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2346  hypothetical protein  41.82 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992111  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1396  hypothetical protein  40.25 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6979  hypothetical protein  39.87 
 
 
172 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0344  hypothetical protein  41.79 
 
 
200 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4057  hypothetical protein  43.07 
 
 
141 aa  98.2  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724167  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1382  hypothetical protein  35.58 
 
 
169 aa  97.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354025  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1502  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  97.4  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.08598  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0769  hypothetical protein  44.63 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379587  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4012  hypothetical protein  38.16 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2785  hypothetical protein  43.85 
 
 
178 aa  94.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000338727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2457  hypothetical protein  48.57 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4693  hypothetical protein  36.94 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1402  hypothetical protein  34.87 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4653  hypothetical protein  55.68 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  hitchhiker  0.00156342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3054  hypothetical protein  47.71 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365359  normal  0.266597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5806  hypothetical protein  41.32 
 
 
145 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1930  hypothetical protein  37.23 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2559  hypothetical protein  33.56 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.685831  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1102  hypothetical protein  48.05 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1639  hypothetical protein  45.98 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32179  normal  0.281351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0921  hypothetical protein  42.16 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0192  hypothetical protein  42.34 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2263  hypothetical protein  37.01 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2338  hypothetical protein  53.01 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2149  hypothetical protein  49.35 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119787  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5828  hypothetical protein  41.38 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.49354 
 
 
-
 
NC_004310  BR0183  hypothetical protein  40.54 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3930  hypothetical protein  43.96 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0185071  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2407  hypothetical protein  44.12 
 
 
131 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1826  hypothetical protein  43.68 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248262  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1863  hypothetical protein  32.87 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3123  hypothetical protein  31.33 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4514  hypothetical protein  49.33 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1353  hypothetical protein  40.87 
 
 
144 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975358  normal  0.124048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2428  hypothetical protein  62.71 
 
 
133 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204848  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0177  hypothetical protein  39.64 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1109  hypothetical protein  31.25 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3993  hypothetical protein  43.75 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1794  hypothetical protein  47.13 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1928  hypothetical protein  47.13 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.320928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3053  hypothetical protein  38.79 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.728603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1567  hypothetical protein  38.79 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1240  hypothetical protein  38.79 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0629  hypothetical protein  38.79 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1434  hypothetical protein  38.79 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1465  hypothetical protein  38.79 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1067  hypothetical protein  38.1 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4394  hypothetical protein  51.47 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  0.0572179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3273  hypothetical protein  39.73 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.715053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1395  hypothetical protein  37.14 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.67 
 
 
374 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0657  hypothetical protein  41.46 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.928845  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1265  hypothetical protein  36.46 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.229462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>