26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  341  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  62.57 
 
 		 317 aa  210  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  59.76 
 
 		 292 aa  183  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  57.31 
 
 		 326 aa  183  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  51.52 
 
 		 339 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  48.15 
 
 		 342 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  43.37 
 
 		 337 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  44.51 
 
 		 244 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  44.3 
 
 		 332 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  44.1 
 
 		 312 aa  131  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  44.3 
 
 		 244 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  46.3 
 
 		 317 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  42.07 
 
 		 267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  40.85 
 
 		 244 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  38.92 
 
 		 231 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  41.1 
 
 		 224 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  38.37 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  39.63 
 
 		 310 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  42.33 
 
 		 330 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  38.36 
 
 		 314 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  33.95 
 
 		 322 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  29.33 
 
 		 347 aa  85.5  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  30.52 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  29.75 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  24.82 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  26.49 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>