25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17680 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  820    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  79.1 
 
 
405 aa  673    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  70.33 
 
 
404 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  69.4 
 
 
405 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  71.16 
 
 
381 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  61.64 
 
 
402 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  50.13 
 
 
402 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  50.13 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  49.61 
 
 
402 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  49.35 
 
 
402 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  47.13 
 
 
402 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  47.58 
 
 
391 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  44.04 
 
 
423 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  34.91 
 
 
395 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  27.46 
 
 
354 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  24.65 
 
 
392 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  25.84 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  26.67 
 
 
375 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  27.68 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  24.18 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  32.09 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  22.52 
 
 
339 aa  53.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  25.09 
 
 
323 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0076  hypothetical protein  30.69 
 
 
109 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  25 
 
 
276 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>