71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11150 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_11150  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  264  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2264  hypothetical protein  44.85 
 
 
137 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124319  normal  0.0478819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3847  hypothetical protein  38.53 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  36.28 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0158  hypothetical protein  38.78 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286891  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3667  hypothetical protein  35.42 
 
 
178 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290827  normal  0.787143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  32.12 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01473  predicted membrane protein i A1501  36.8 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  33.02 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  28.99 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0562  hypothetical protein  32.37 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3100  hypothetical protein  31.21 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3827  hypothetical protein  31.21 
 
 
170 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78759  normal  0.497757 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  32.77 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  33.05 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  32.04 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  28.32 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  28.32 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  24.09 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  31.88 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  28.37 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  31.07 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  31.88 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  26.95 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  31.3 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  24.26 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  25.93 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  27.78 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  29.66 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  31.16 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  31.16 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  26.32 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  27.78 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  29.31 
 
 
194 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  24.26 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  31.53 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  29.52 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  28.7 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  28.78 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  30 
 
 
195 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  26.79 
 
 
197 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  28.46 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  27.52 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  30.94 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  30.28 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  31.53 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2312  hypothetical protein  31.78 
 
 
172 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152747  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  30.94 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  30.94 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  30.22 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  30.22 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  26.28 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  28.32 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  34.44 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  30.22 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  30.22 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  26.32 
 
 
148 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  30.97 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  30.91 
 
 
190 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  24.58 
 
 
187 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  29.5 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  26.28 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  30.36 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  23.73 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  25.19 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  24.55 
 
 
188 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>