19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_05830  TraX domain-containing membrane protein  100 
 
 		 246 aa  461  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2245  TraX family protein  44.64 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0036166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0411  hypothetical protein  48.89 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4765  hypothetical protein  47.75 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.160145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5209  hypothetical protein  51.27 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2699  TraX family protein  44.16 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5167  TraX family protein  44.02 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2346  TraX family protein  27.68 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0272  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  36.92 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0030  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  36.92 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0080  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  36.92 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.391686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4312  TraX family protein  47.46 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.60113  decreased coverage  0.000185493 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4260  conjugal transfer protein TrbP  32.39 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457278 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0480  TraX family protein  25.4 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1445  hypothetical protein  28.83 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6621  conjugal transfer protein TrbP  31.69 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6516  conjugal transfer protein TrbP  31.69 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0009  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  36.92 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000759662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2132  conjugal transfer protein TrbP  30.77 
 
 		 214 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>