15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5209 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5209  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0411  hypothetical protein  56.39 
 
 		 248 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4765  hypothetical protein  54.01 
 
 		 248 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.160145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2245  TraX family protein  43.97 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0036166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05830  TraX domain-containing membrane protein  51.27 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5167  TraX family protein  43.83 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2699  TraX family protein  38.89 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1445  hypothetical protein  31.9 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2132  conjugal transfer protein TrbP  35.63 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2346  TraX family protein  28.39 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0480  TraX family protein  27.08 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5825  conjugal transfer protein TrbP  28.63 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.516785  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6516  conjugal transfer protein TrbP  37.5 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6621  conjugal transfer protein TrbP  37.5 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4260  conjugal transfer protein TrbP  37.5 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>