20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7266 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 321 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  58.57 
 
 		 321 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  45.71 
 
 		 326 aa  255  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  45.71 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  45.09 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  37.28 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  37.28 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  31.23 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  28.87 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  31.61 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  25 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  25 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  25 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  22.98 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  23.46 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  21.94 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  21.63 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  25.25 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  24.92 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  23.3 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>