65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3243 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  68.88 
 
 		 302 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  67.01 
 
 		 300 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  67.83 
 
 		 302 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  52.82 
 
 		 303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  52.82 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  51.99 
 
 		 303 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  54.23 
 
 		 307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.1 
 
 		 294 aa  272  6e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  42.05 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  46.07 
 
 		 298 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  42.14 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  41.37 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  42.5 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  40.92 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  41.82 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  39.93 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  40.56 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  40.56 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  40.88 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  41.76 
 
 		 316 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  41.16 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  40.36 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  40.55 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  41.03 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  42.12 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  37 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  36 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  37.87 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  36.43 
 
 		 326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0989  metallophosphoesterase  34.66 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1046  metallophosphoesterase  31.92 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.541115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1050  metallophosphoesterase  32.49 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  31 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  26.9 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  24.73 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  27.34 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  27.78 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  27.04 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  23.97 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  27.88 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  28.22 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  26.58 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  27.04 
 
 		 273 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  27.88 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  22.43 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  33.61 
 
 		 290 aa  49.7  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  28.14 
 
 		 266 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  30.3 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  31.98 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  25.11 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  25.39 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3876  metallophosphoesterase  24.63 
 
 		 366 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3826  metallophosphoesterase  24.63 
 
 		 366 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  26.98 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0148  metallophosphoesterase  24.81 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0125626  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  28.12 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2484  phosphohydrolases  30.39 
 
 		 375 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  22.98 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5168  metallophosphoesterase  33.01 
 
 		 398 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0894329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4868  metallophosphoesterase  33.01 
 
 		 391 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4782  metallophosphoesterase  33.01 
 
 		 391 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2865  metallophosphoesterase  25.1 
 
 		 235 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0711307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  25.1 
 
 		 369 aa  42.4  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>