170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2885 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  100 
 
 
309 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  64.21 
 
 
309 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  63.54 
 
 
310 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  63.19 
 
 
310 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  46.58 
 
 
295 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  46.02 
 
 
295 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  46.59 
 
 
288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  48.85 
 
 
291 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  38.71 
 
 
308 aa  202  7e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.33 
 
 
291 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  35.79 
 
 
332 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  35.6 
 
 
330 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  36.18 
 
 
349 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  35.19 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  37.14 
 
 
302 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  36.14 
 
 
346 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  33.47 
 
 
329 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.71 
 
 
334 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.62 
 
 
324 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  33.99 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.2 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  32.63 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  33.74 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.74 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.84 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.17 
 
 
327 aa  128  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  33.65 
 
 
331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.41 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  31.55 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  30.19 
 
 
299 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  31.35 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  29.2 
 
 
312 aa  89  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  28.92 
 
 
308 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.43 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  28.92 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  29.35 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  25.51 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  26.53 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  29.5 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.79 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  29.76 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.53 
 
 
278 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  25.76 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0749  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.75 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116694  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0953  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.37 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0749  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.85 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04364  cell division protein FtsQ  29.08 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.749304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3424  cell division protein FtsQ  29.41 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.291979  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1116  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.24 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00697393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  26.9 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  22.73 
 
 
271 aa  60.8  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0764  cell division protein FtsQ  26.47 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1045  cell division protein FtsQ  28.12 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00015927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3453  cell division septal protein-like  27.41 
 
 
347 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  22.82 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2670  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.09 
 
 
250 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3467  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000457508  hitchhiker  0.00184571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.29 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  22.71 
 
 
627 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0489  putative cell division transmembrane protein, FtsQ  25.45 
 
 
250 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0227105  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3384  cell division protein FtsQ  24.48 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000592378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3515  cell division protein FtsQ  24.48 
 
 
263 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3495  cell division protein FtsQ  26 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0823778  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.04 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2265  cell division protein FtsQ  25.36 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.245819  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3802  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.63 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0128831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3285  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.67 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.098326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0356  cell division protein FtsQ  23.85 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0605  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1022  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.19 
 
 
259 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00172574  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2045  cell division protein  27.96 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000010685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1966  cell division protein FtsQ  27.96 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000753144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  22.33 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1977  cell division protein FtsQ  24.62 
 
 
260 aa  52.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00013353  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  24.21 
 
 
276 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  20.1 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004488  cell division protein FtsQ  25.14 
 
 
260 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00754349  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  24.21 
 
 
276 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  24.21 
 
 
276 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  24.21 
 
 
276 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2784  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.76 
 
 
298 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.397711  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  23.88 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2642  cell division protein FtsQ  23.11 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  25.25 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0184  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.68 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000203448  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.48 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000561241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4670  cell division protein FtsQ  22.86 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000533312  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1968  cell division protein  23.26 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00917782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0228  cell division protein FtsQ  23.26 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000146493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2873  cell division protein FtsQ  24 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0613  cell division protein FtsQ  20.88 
 
 
284 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0180301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0495  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.81 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0899  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.45 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3507  cell division protein FtsQ  25.52 
 
 
276 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000541372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3667  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.08 
 
 
277 aa  50.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.364111  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2977  cell division protein FtsQ  24.08 
 
 
277 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00192048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3564  cell division protein FtsQ  25.52 
 
 
276 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0148979  normal  0.0119614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0415  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.04 
 
 
262 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235658  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1121  cell division protein FtsQ  24.39 
 
 
250 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00094  membrane anchored protein involved in growth of wall at septum  25.52 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>