280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0961 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0961  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  693    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  48.96 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  45.69 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  31.86 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  25.27 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  25.96 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  28.46 
 
 		 660 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  29.43 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  27.18 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  25.3 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  26.79 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  25.42 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  26.76 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  27.09 
 
 		 695 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  28.09 
 
 		 671 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  25.13 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  26.18 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6951  acyltransferase-like protein  25.34 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  25.67 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  27.3 
 
 		 690 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  26.88 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  24.74 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  25.5 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  27.15 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  24.74 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  27.57 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  28.39 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  28.02 
 
 		 695 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  25.21 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  25.87 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  24.74 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  24.66 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  27.2 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  27.2 
 
 		 647 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  27.32 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  25.75 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  23.7 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  26.95 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3191  acyltransferase 3  27.52 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300481  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  27.59 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  26.97 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  28.17 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  26.97 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  26.97 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  28.84 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  27.85 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  27.41 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  27.41 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  27.42 
 
 		 690 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  26.7 
 
 		 634 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4389  acyltransferase 3  30.41 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3978  acyltransferase 3  30.41 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  30.72 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  29.97 
 
 		 448 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  25.96 
 
 		 657 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  31.08 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  24.87 
 
 		 710 aa  56.6  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  33.57 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  25.58 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  33.81 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  25.47 
 
 		 716 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  24.23 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  25.99 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  25.21 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  28.53 
 
 		 642 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  25 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  26.88 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  26.91 
 
 		 629 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  24.78 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  28.1 
 
 		 662 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  28.85 
 
 		 665 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  26.5 
 
 		 684 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.89 
 
 		 639 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16030  Acyltransferase 3 family protein  27.97 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0004457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  32.24 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  28.11 
 
 		 681 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  26.69 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  25.48 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  32.24 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  25.92 
 
 		 640 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  24.59 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  36.59 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  36.59 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  27.09 
 
 		 675 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  31.94 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2589  acyltransferase 3  33.61 
 
 		 696 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  25.89 
 
 		 435 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  27.54 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3115  acyltransferase 3  26.26 
 
 		 546 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  27.2 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3551  acyltransferase 3  29.34 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25.35 
 
 		 660 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6866  acyltransferase 3  29.91 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  24.37 
 
 		 654 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  24.15 
 
 		 373 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  26.3 
 
 		 392 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  24.93 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  25.94 
 
 		 363 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0732  hypothetical protein  41.76 
 
 		 398 aa  52.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.86 
 
 		 660 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>