More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0126 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  100 
 
 		 481 aa  963    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  61.49 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  60.81 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  56.58 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  49.04 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  51.06 
 
 		 477 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  45.4 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.76 
 
 		 469 aa  375  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.83 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  44.81 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.78 
 
 		 517 aa  355  7.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  47.11 
 
 		 469 aa  352  7e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.97 
 
 		 490 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.7 
 
 		 475 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.12 
 
 		 510 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.04 
 
 		 474 aa  346  7e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.91 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  46.85 
 
 		 466 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.31 
 
 		 472 aa  342  9e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  43.46 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  43.46 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  42.53 
 
 		 478 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  43.46 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  39.92 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  43.25 
 
 		 477 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  40.97 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  46.53 
 
 		 469 aa  323  6e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.42 
 
 		 465 aa  322  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  40.18 
 
 		 445 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.04 
 
 		 1553 aa  282  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  30.91 
 
 		 459 aa  129  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  29.29 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  27.5 
 
 		 458 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.02 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3596  phosphoglucosamine mutase  29.73 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  28.8 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  26.91 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  25.64 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  28.01 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  26.78 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  25.84 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  25.41 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  27 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  26.15 
 
 		 452 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  30.17 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  26.86 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  27.07 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  26.48 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.5 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  27.58 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1095  phosphoglucosamine mutase  28.89 
 
 		 489 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0973  phosphoglucosamine mutase  27.46 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0722  phosphoglucosamine mutase  29.89 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  27.66 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  26.02 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2612  phosphoglucosamine mutase  28.03 
 
 		 449 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  28.25 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  26.28 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16830  phosphoglucosamine mutase  28.54 
 
 		 448 aa  100  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  29.04 
 
 		 452 aa  99.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  26 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.65 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  26.61 
 
 		 451 aa  97.8  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.66 
 
 		 452 aa  97.8  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 		 450 aa  97.8  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  27.75 
 
 		 459 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2916  phosphoglucosamine mutase  27.73 
 
 		 452 aa  97.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  26.22 
 
 		 449 aa  97.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  28.54 
 
 		 447 aa  96.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2839  phosphoglucosamine mutase  28 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0717  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  29.73 
 
 		 447 aa  95.9  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  25.16 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  27.65 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27 
 
 		 456 aa  95.1  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  28.69 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  26.02 
 
 		 451 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  28.33 
 
 		 445 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  26.37 
 
 		 483 aa  94  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  25.83 
 
 		 454 aa  94  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  26.91 
 
 		 451 aa  93.6  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  26.91 
 
 		 451 aa  93.6  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  26.92 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  28.41 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  27.1 
 
 		 447 aa  93.2  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0847  phosphoglucosamine mutase  26.07 
 
 		 485 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  27.2 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2625  phosphoglucosamine mutase  26.8 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.629933 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0818  phosphoglucosamine mutase  26.07 
 
 		 485 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  26.97 
 
 		 442 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1687  phosphoglucosamine mutase  29.49 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  27.86 
 
 		 446 aa  92.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  29.09 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  30.42 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23210  phosphoglucosamine mutase  28.22 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0474709  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  25.96 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  28.41 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.8 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  26.83 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  26.21 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>