40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4644 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4644  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  288  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.199743  normal  0.0327695 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5284  hypothetical protein  66.96 
 
 
123 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719748  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0987  hypothetical protein  67.27 
 
 
117 aa  154  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.827224  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3797  hypothetical protein  63.16 
 
 
121 aa  150  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000000371687  hitchhiker  0.0000203227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0635  hypothetical protein  66.67 
 
 
129 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0025  hypothetical protein  47.86 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000365289  hitchhiker  0.00178909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0664  hypothetical protein  44.35 
 
 
118 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8075  hypothetical protein  41.38 
 
 
224 aa  99.4  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.712439  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1136  hypothetical protein  66.67 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318974  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2476  hypothetical protein  45.61 
 
 
115 aa  97.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.330028  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0025  hypothetical protein  42.61 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0011  hypothetical protein  42.61 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.769725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1456  hypothetical protein  45.13 
 
 
112 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.125825  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2395  hypothetical protein  43.24 
 
 
115 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2394  hypothetical protein  38.33 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3626  hypothetical protein  37.29 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4344  Protein of unknown function DUF2137  43.59 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0389295  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3674  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12057  hypothetical protein  42.72 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1923  diaminopimelate decarboxylase  46.07 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.204228  normal  0.010651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0628  hypothetical protein  42.86 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13204  hypothetical protein  41.67 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000225014  normal  0.415725 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3536  hypothetical protein  38.89 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0389  hypothetical protein  38.6 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  34.71 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  34.71 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7018  hypothetical protein  38.6 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5819  helix-turn-helix domain-containing protein  45.78 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.608546  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6665  hypothetical protein  43.68 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2881  hypothetical protein  44.44 
 
 
116 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00385493  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  28.57 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  23.42 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  22.08 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  30 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  28.92 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0387  prophage protein gp49  39.06 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215014  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1798  hypothetical cytosolic protein  39.06 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  28.92 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  28.92 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  25 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>