26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2929 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2929  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0293  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  52.48 
 
 
151 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0418  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.36 
 
 
492 aa  94.7  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.092568  normal  0.037069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3484  HEAT domain-containing protein  37.22 
 
 
203 aa  87  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.438064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5046  heat domain-containing protein  38.06 
 
 
214 aa  72  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2935  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.02 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.962071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0661  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.43 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3047  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.19 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3073  HEAT domain containing protein  38.19 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1691  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.84 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.89 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1912  phycocyanobilin lyase beta subunit  31.16 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.43 
 
 
644 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 
1343 aa  48.5  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  31.21 
 
 
958 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.78 
 
 
395 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  33.33 
 
 
321 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.73 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.64 
 
 
510 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2382  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.509121  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.71 
 
 
1438 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  29.33 
 
 
646 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.99 
 
 
1181 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  27.09 
 
 
1094 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.28 
 
 
524 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.67 
 
 
646 aa  41.6  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>