17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2230 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  78.03 
 
 
173 aa  276  9e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  63.53 
 
 
165 aa  217  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  60.48 
 
 
325 aa  199  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  63.16 
 
 
165 aa  198  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  63.16 
 
 
165 aa  198  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  50 
 
 
319 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  49.7 
 
 
319 aa  157  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  49.02 
 
 
160 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  51.43 
 
 
166 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  47.88 
 
 
319 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  48.8 
 
 
318 aa  154  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  46.05 
 
 
163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  37.5 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  29.17 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  34.34 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  28.15 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>