29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1639 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1639  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44073  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4388  OstA family protein  76.97 
 
 		 165 aa  245  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2167  OstA family protein  53.64 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2120  OstA family protein  53.64 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3750  OstA family protein  53.9 
 
 		 162 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2273  OstA-like protein  53.85 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2506  OstA family protein  55.94 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.979072  normal  0.875661 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0514  hypothetical protein  62.38 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.488743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16781  hypothetical protein  48.48 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.353527 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1245  hypothetical protein  41.86 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1234  hypothetical protein  38.74 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  30.47 
 
 		 791 aa  48.5  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  23.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  31.97 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2416  cell envelope biogenesis YhbN  25.61 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0334942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  35.53 
 
 		 786 aa  41.2  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>