29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2006 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0249  hypothetical protein  53.23 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  55.93 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  52.38 
 
 
70 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1351  protein of unknown function UPF0150  50.79 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  50.79 
 
 
70 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  53.06 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.078496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5957  hypothetical protein  50.98 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0871  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302408  normal  0.0367902 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_4651  protein of unknown function UPF0150  49.21 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000711618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  59.09 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  56.82 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  38.24 
 
 
73 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1229  protein of unknown function UPF0150  49.23 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2236  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785928  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4378  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4316  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3012  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4318  protein of unknown function UPF0150  53.66 
 
 
51 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1747  hypothetical protein  45.83 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19825  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0904  hypothetical protein  39.22 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.706958  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  48.94 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  48.94 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  44.68 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0715  hypothetical protein  52.27 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.595096  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  43.75 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3222  hypothetical protein  42.86 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151978  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>