21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1229 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1229  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 73 aa  143  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  53.73 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  49.23 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0249  hypothetical protein  45.16 
 
 		 71 aa  62  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  49.25 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  54.72 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.078496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1351  protein of unknown function UPF0150  42.19 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5957  hypothetical protein  54.72 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  47.37 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3012  hypothetical protein  54.9 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0871  hypothetical protein  40.62 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302408  normal  0.0367902 
 
 
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  47.69 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4651  protein of unknown function UPF0150  42.19 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000711618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  47.73 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1747  hypothetical protein  41.67 
 
 		 79 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19825  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4318  protein of unknown function UPF0150  40.43 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2236  protein of unknown function UPF0150  40.43 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4008  hypothetical protein  52.63 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>