39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1875 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1875  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  100 
 
 		 320 aa  634    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  24.6 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  22.69 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  24.5 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2565  type IV pilus assembly protein PilM  24.57 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  20.79 
 
 		 383 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  22.34 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.13 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  20.38 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  16.27 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  30.93 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.31 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  23.17 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  22.02 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  21.71 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  22.5 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  21.18 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  30.23 
 
 		 368 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  28.93 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  21.3 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  21.26 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  21.26 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  20.32 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  30.41 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  19.18 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  22.52 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0184  type IV pilus assembly protein PilM  26.35 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  21.56 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  20.97 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  18.93 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0076  type IV pilus assembly protein PilM  20.18 
 
 		 749 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0307  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.37 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  19.11 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  21.34 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  22 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  25.83 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  21.05 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0953  type IV pilus assembly protein PilM  20.21 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>