More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1959 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  74.33 
 
 
523 aa  690    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  100 
 
 
488 aa  940    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  63.68 
 
 
500 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  56.69 
 
 
497 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  60.14 
 
 
548 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.89 
 
 
491 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  50.23 
 
 
480 aa  359  5e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 
496 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  44.42 
 
 
486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 
496 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7581  putative multidrug transport protein  45.5 
 
 
477 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 
489 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  38.55 
 
 
490 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  40.68 
 
 
500 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 
497 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.34 
 
 
502 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.61 
 
 
495 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.12 
 
 
495 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  36.67 
 
 
487 aa  293  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 
491 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.71 
 
 
517 aa  291  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 
491 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.53 
 
 
489 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.77 
 
 
506 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.21 
 
 
479 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.21 
 
 
478 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.21 
 
 
478 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.11 
 
 
476 aa  286  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.21 
 
 
479 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  38.21 
 
 
478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.77 
 
 
495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.97 
 
 
478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  37.97 
 
 
478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 
480 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 
448 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.22 
 
 
469 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  40.53 
 
 
481 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.54 
 
 
569 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.82 
 
 
513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.82 
 
 
513 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.34 
 
 
513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  35.34 
 
 
513 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  35.34 
 
 
513 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.34 
 
 
513 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.34 
 
 
513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 
500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.02 
 
 
513 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.02 
 
 
513 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.34 
 
 
513 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 
511 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 
666 aa  250  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 
450 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
449 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.57 
 
 
431 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 
501 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 
504 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 
484 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.05 
 
 
697 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 
522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.99 
 
 
535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  33.9 
 
 
507 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  38.35 
 
 
1062 aa  233  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.89 
 
 
685 aa  233  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 
539 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.71 
 
 
511 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.18 
 
 
593 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 
511 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 
511 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 
511 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.92 
 
 
562 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 
555 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 
511 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  33.17 
 
 
507 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.91 
 
 
519 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  31.48 
 
 
511 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 
678 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  38.21 
 
 
666 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  32.12 
 
 
511 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 
682 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.71 
 
 
682 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.71 
 
 
682 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 
508 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  35.84 
 
 
537 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.52 
 
 
509 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.52 
 
 
509 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 
504 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.38 
 
 
504 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.52 
 
 
504 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.38 
 
 
525 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.76 
 
 
541 aa  223  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 
525 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.52 
 
 
565 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  33.81 
 
 
487 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.92 
 
 
641 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.17 
 
 
538 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.08 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
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NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.33 
 
 
650 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
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NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.26 
 
 
535 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
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NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.05 
 
 
685 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
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NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 
528 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
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