36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0952 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  434  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2181  Excalibur domain-containing protein  35.15 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  40.46 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  39.37 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  39.37 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  37.04 
 
 
331 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  39.37 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  36.73 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  37.8 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  36.57 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  73.17 
 
 
287 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  46.91 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  35.04 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  57.69 
 
 
382 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  48.75 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  61.11 
 
 
389 aa  58.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  54.84 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0302  Excalibur domain protein  82.5 
 
 
319 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  64.86 
 
 
351 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  66.67 
 
 
115 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  62.75 
 
 
154 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  40.91 
 
 
138 aa  55.1  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  52.38 
 
 
303 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6539  Excalibur domain-containing protein  53.42 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  52.27 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  59.46 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0723  hypothetical protein  70.27 
 
 
142 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  51.35 
 
 
77 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  47.22 
 
 
443 aa  48.5  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  31.46 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  31.46 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3198  PASTA domain containing protein  41.27 
 
 
125 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  67.5 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23250  PASTA domain-containing protein  37.66 
 
 
127 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal  0.676716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5756  hypothetical protein  32.81 
 
 
129 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.384038 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.85 
 
 
627 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>