25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0719 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  231  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  76.92 
 
 
116 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  47.11 
 
 
115 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  41.35 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  39.42 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  42 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  42.86 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  40.86 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  42.53 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  43.3 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  37.62 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  39.56 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  34.65 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03620  Protein of unknown function (DUF2516)  35.29 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.693043  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  40.24 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  36.17 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  41.33 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  40.62 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03700  hypothetical protein  33.02 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00236427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  34.94 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  30.69 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0318  hypothetical protein  30.69 
 
 
108 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  31.58 
 
 
97 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3024  hypothetical protein  36.14 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>