21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1826 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  881    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  38.76 
 
 		 2077 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  27.82 
 
 		 1669 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  25.95 
 
 		 1642 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  27.53 
 
 		 1669 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  29.91 
 
 		 2274 aa  76.6  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  24.4 
 
 		 2005 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  25.5 
 
 		 1649 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  23.23 
 
 		 1697 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  27.95 
 
 		 766 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  30.85 
 
 		 1706 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  23.77 
 
 		 1700 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  24.38 
 
 		 1697 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  25.93 
 
 		 1925 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1748 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 2570 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  21.83 
 
 		 1702 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  41.67 
 
 		 1726 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  21.74 
 
 		 1701 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  35.71 
 
 		 1575 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  33.72 
 
 		 1932 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>