23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1209 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1209  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  238  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19120  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.82 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.651626  normal  0.248755 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13870  hypothetical protein  49.47 
 
 		 249 aa  90.9  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0937  protein of unknown function UPF0102  39.42 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  30.7 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  30.77 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1525  protein of unknown function UPF0102  30.83 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0905238 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  31.09 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  29.2 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  34.15 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  34.15 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20220  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  29 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0533456  normal  0.101532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  24.32 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  25.83 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  29.7 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  26.73 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  27.03 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  28.07 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  29.25 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  29.29 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  26.92 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  27.36 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  26.17 
 
 		 134 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>