150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1095 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  53.45 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.15 
 
 		 122 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2832  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.39 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11750  Sec-independent protein secretion pathway component  46.39 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.52 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  60.87 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  60.87 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 91 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.14 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.26 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  42.59 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19840  Sec-independent protein secretion pathway component  41.58 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.87482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.74 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.76 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.4 
 
 		 106 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  52.5 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  43.86 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  43.86 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  32.18 
 
 		 96 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.38 
 
 		 115 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  45.1 
 
 		 88 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.55 
 
 		 64 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 		 59 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.68 
 
 		 94 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 		 88 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 		 88 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  40.68 
 
 		 77 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  41.79 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  43.75 
 
 		 89 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  43.64 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 		 95 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.2 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  46.15 
 
 		 110 aa  52  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 69 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  49.06 
 
 		 55 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  47.62 
 
 		 60 aa  51.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  52.38 
 
 		 56 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  47.73 
 
 		 66 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  52.38 
 
 		 55 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  48.72 
 
 		 84 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  50 
 
 		 130 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 56 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  36.84 
 
 		 83 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.74 
 
 		 116 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.44 
 
 		 87 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  44.9 
 
 		 71 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  44.9 
 
 		 71 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.18 
 
 		 146 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 		 67 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.18 
 
 		 139 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.18 
 
 		 139 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  37.25 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.03 
 
 		 99 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  37.25 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.68 
 
 		 96 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.48 
 
 		 99 aa  47.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.44 
 
 		 55 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  45 
 
 		 57 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.73 
 
 		 62 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.04 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 62 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.81 
 
 		 58 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  42.11 
 
 		 118 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  39.58 
 
 		 104 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.81 
 
 		 58 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  28.98 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.98 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.67 
 
 		 96 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  42.86 
 
 		 60 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45 
 
 		 79 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  40.68 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.06 
 
 		 145 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.67 
 
 		 96 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.98 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  28.98 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  28.98 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  28.98 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  28.98 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  31.33 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  28.98 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.84 
 
 		 89 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  28.98 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  28.98 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1041  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.51 
 
 		 77 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.59 
 
 		 77 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  26.85 
 
 		 180 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1082  twin arginine-targeting protein translocase  41.51 
 
 		 77 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  38.6 
 
 		 120 aa  45.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.89 
 
 		 74 aa  45.4  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  47.37 
 
 		 104 aa  45.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>