More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0383 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0383  ribosomal protein S15  100 
 
 
84 aa  169  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00305876  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  57.83 
 
 
88 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  60.26 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  57.69 
 
 
89 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2416  ribosomal protein S15  55.13 
 
 
88 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  57.69 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  63.77 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  56.96 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
87 aa  90.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  57.69 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  57.69 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
88 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  55.84 
 
 
88 aa  90.1  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  90.1  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  57.69 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  58.97 
 
 
89 aa  89.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  56.41 
 
 
89 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  56.41 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  52.56 
 
 
88 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  52.56 
 
 
87 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  60.26 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  56.41 
 
 
89 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  55.41 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  58.97 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  55.13 
 
 
87 aa  88.6  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  57.69 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  57.69 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  57.69 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  55.26 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  57.69 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  53.01 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  56.41 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  56.41 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  48.81 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  56.41 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  87.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
88 aa  87.8  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  54.55 
 
 
88 aa  87.8  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  57.69 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  55.41 
 
 
88 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  55.41 
 
 
88 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  55.13 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  56.41 
 
 
89 aa  87  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  51.28 
 
 
89 aa  87  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  56.41 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  54.05 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  52.56 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  57.69 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  51.95 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  56.41 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  51.95 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  51.28 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  55.13 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2817  30S ribosomal protein S15  53.25 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1010  30S ribosomal protein S15  56.41 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.876313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  60.87 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  55.13 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  51.28 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>