18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0350 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 358 aa  724    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  34.71 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  34.44 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  30.92 
 
 		 356 aa  136  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  28.71 
 
 		 340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  28.37 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  31.36 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  29.51 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  26.61 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  31.03 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  27.97 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  27.3 
 
 		 339 aa  86.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  32.39 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  29.83 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  37.84 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  20.75 
 
 		 416 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  34.04 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4135  DNA ligase, ATP-dependent  32.31 
 
 		 571 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>