162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4416 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4416  cobalamin synthesis CobW domain protein  100 
 
 		 363 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00259515  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3290  cobalamin synthesis CobW domain protein  48.92 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.565561  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4732  cobalamin synthesis CobW-like protein  44.13 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4818  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  44.13 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0671269  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5117  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  44.13 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624454  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10107  hypothetical protein  46.18 
 
 		 398 aa  235  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5488  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  45.53 
 
 		 373 aa  225  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133332  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5332  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  44 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1313  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  45.82 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.736544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1469  cobalamin synthesis CobW domain protein  44.72 
 
 		 442 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.097532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4195  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  41.1 
 
 		 426 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.393876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2902  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  39.58 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2856  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  39.39 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221886  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3371  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  38.01 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  35.24 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  36.31 
 
 		 540 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  35.19 
 
 		 408 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  29.17 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  29.17 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 401 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  33.52 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  31.56 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  34.73 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  31.99 
 
 		 401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  34.63 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  32.28 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  33.88 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  31.85 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  31.27 
 
 		 406 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  32.64 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  33.88 
 
 		 436 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  33.88 
 
 		 436 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  32.96 
 
 		 438 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  28.53 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.23 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  33.82 
 
 		 397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  33.62 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  33.04 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  32.46 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.72 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  33.83 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  33.53 
 
 		 407 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  34.88 
 
 		 423 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  31.7 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  33.61 
 
 		 470 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  30.68 
 
 		 402 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  33.04 
 
 		 399 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  31.81 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  33.06 
 
 		 437 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.11 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.51 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.23 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.23 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  32.23 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  32.16 
 
 		 410 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  34.58 
 
 		 435 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  29.6 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  29.24 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  30.17 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  32.23 
 
 		 446 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  33.53 
 
 		 423 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  33.53 
 
 		 423 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.96 
 
 		 446 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  33.53 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  32.65 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  31.49 
 
 		 404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  30.81 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  30.24 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  33.23 
 
 		 403 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  29.31 
 
 		 402 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  29.28 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  32.06 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  30.7 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  33.8 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.78 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  27.94 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  30.6 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3068  cobalamin synthesis protein P47K  34.81 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0294882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  34.19 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  28.24 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  29.62 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  29.79 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  30.38 
 
 		 424 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  31.2 
 
 		 401 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.41 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  31.31 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.41 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  31.21 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  32.08 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  30.12 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  31.3 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  29.03 
 
 		 442 aa  109  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  28.76 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  30.14 
 
 		 407 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  32.54 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  30.52 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  28.74 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>