21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4131 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 635 aa  1263    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  34.09 
 
 		 600 aa  295  1e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 627 aa  241  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  27.92 
 
 		 640 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  25.62 
 
 		 404 aa  101  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  25.71 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  26.76 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  26.94 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14820  hypothetical protein  27.2 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0771  hypothetical protein  27.91 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  27.37 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1078  hypothetical protein  27.62 
 
 		 425 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1185  hypothetical protein  26.44 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2011  hypothetical protein  24.79 
 
 		 405 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0195  hypothetical protein  25.44 
 
 		 429 aa  52.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25 
 
 		 394 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3584  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.121359  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5000  hypothetical protein  24.12 
 
 		 406 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1143  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1026 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0637346  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  21.6 
 
 		 381 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.307067 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  26.04 
 
 		 409 aa  44.3  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0788687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>