48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3312 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 68 aa  134  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  65.15 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  57.35 
 
 		 76 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  59.02 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4665  4-oxalocrotonate tautomerase  55.38 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  43.55 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4438  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2694  putative tautomerase  38.46 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0593084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  46.03 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  41.54 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4696  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  hitchhiker  0.00079321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4689  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.091228  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  39.68 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.92 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.7 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.48 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.43 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  36.51 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.35 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.92 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 67 aa  43.5  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.07 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2693  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.46733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  36.49 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5867  putative tautomerase protein  40 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0453525  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.07 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  40.68 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.43 
 
 		 67 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 67 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.43 
 
 		 67 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  40.3 
 
 		 63 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>