13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3113 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3113  plasmid-related protein  100 
 
 		 649 aa  1307    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1501  hypothetical protein  35.42 
 
 		 639 aa  330  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.33375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2023  hypothetical protein  23.76 
 
 		 656 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.446279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3362  hypothetical protein  24.86 
 
 		 665 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3388  hypothetical protein  25.96 
 
 		 668 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0805  hypothetical protein  27.14 
 
 		 652 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.707828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0209  hypothetical protein  22.69 
 
 		 660 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0547136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0472  hypothetical protein  24.78 
 
 		 664 aa  112  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.138177  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0839  hypothetical protein  23.19 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4535  hypothetical protein  25.11 
 
 		 667 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3809  hypothetical protein  25.07 
 
 		 616 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000888518 
 
 
-
 
NC_002950  PG0833  hypothetical protein  20.3 
 
 		 621 aa  86.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.44274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1751  AYP/GTP-binding protein  24.09 
 
 		 616 aa  80.1  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>