90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2997 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2997  protein of unknown function DUF664  100 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  68.53 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  61.29 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  59.87 
 
 		 396 aa  160  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1764  hypothetical protein  44.37 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.273474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  44.03 
 
 		 166 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  40.88 
 
 		 172 aa  90.9  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2390  hypothetical protein  35.8 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265375  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  37.13 
 
 		 167 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  38.51 
 
 		 169 aa  87.8  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7026  protein of unknown function DUF664  41.67 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.99462  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  36.88 
 
 		 186 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  38.46 
 
 		 175 aa  87.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  40.52 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  38.75 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0432  hypothetical protein  36.21 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  40.12 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  41.96 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  34.42 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  37.71 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  34.57 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1132  putative mini-circle protein  48.39 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  37.35 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  41.4 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20480  Protein of unknown function (DUF664)  37.85 
 
 		 188 aa  73.6  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.247017  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  36.02 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  38.36 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  35.26 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0256  protein of unknown function DUF664  40 
 
 		 204 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  36.71 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0936  hypothetical protein  36.31 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  36.52 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  35.5 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  39.5 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  35.11 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  34.81 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  34.39 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  34.1 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0659  protein of unknown function DUF664  35.06 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  34.42 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  34.94 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  32.91 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  35.22 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  33.33 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0342  protein of unknown function DUF664  33.77 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0973615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  38.36 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5165  protein of unknown function DUF664  30.77 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0637  protein of unknown function DUF664  35.93 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  32.56 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5108  hypothetical protein  29.81 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408791  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  33.13 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5436  hypothetical protein  32.03 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  33.72 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  33.53 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  34.39 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  32.32 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6378  hypothetical protein  35.44 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  34.16 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  31.18 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5542  protein of unknown function DUF664  34.57 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  41.98 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3489  protein of unknown function DUF664  32.92 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.920969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  36.36 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0339  protein of unknown function DUF664  32.26 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2899  hypothetical protein  34.15 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.792533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1245  hypothetical protein  30.11 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1618  hypothetical protein  34.81 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1751  protein of unknown function DUF664  33.77 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0247  protein of unknown function DUF664  36.24 
 
 		 211 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4136  protein of unknown function DUF664  33.33 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  31.82 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5401  protein of unknown function DUF664  30.18 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0958  hypothetical protein  31.43 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0976  hypothetical protein  31.43 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0645805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0979  hypothetical protein  31.43 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2348  hypothetical protein  44.16 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3198  protein of unknown function DUF664  30.25 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3866  protein of unknown function DUF664  37.84 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3194  protein of unknown function DUF664  32.28 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2794  protein of unknown function DUF664  36.09 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127816  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1196  hypothetical protein  38.27 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.974573  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0081  protein of unknown function DUF664  32.12 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.651534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1689  protein of unknown function DUF664  33.54 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4006  protein of unknown function DUF664  31.21 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0741  protein of unknown function DUF664  30.25 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  32.56 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3935  hypothetical protein  32.72 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  hitchhiker  0.00874096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0477  protein of unknown function DUF664  40 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4040  protein of unknown function DUF664  28.85 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19820  Protein of unknown function (DUF664)  29.94 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.867653  hitchhiker  0.00266163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>