98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2228 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  100 
 
 
275 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22120  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  82.76 
 
 
273 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2152  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  74.63 
 
 
275 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2457  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  72.53 
 
 
276 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3065  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  70.9 
 
 
288 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0788326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3148  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  72.01 
 
 
284 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215916  normal  0.672211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3198  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  72.01 
 
 
284 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3136  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  72.01 
 
 
284 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3462  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  70.9 
 
 
275 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2677  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  72.79 
 
 
296 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4474  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  67.77 
 
 
294 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2238  hypothetical protein  70.11 
 
 
318 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2355  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  68.75 
 
 
326 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805289  normal  0.143216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2416  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  66.18 
 
 
330 aa  368  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2632  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  64.94 
 
 
344 aa  359  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12150  RNA methyltransferase  65.58 
 
 
280 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20910  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  63.77 
 
 
349 aa  354  8.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4884  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  69 
 
 
358 aa  351  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340373  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2306  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  65.9 
 
 
305 aa  349  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00564306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1839  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  65.07 
 
 
296 aa  347  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.865717  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1810  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  62.5 
 
 
298 aa  345  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1857  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  62.45 
 
 
363 aa  345  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5892  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  63.24 
 
 
289 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0406172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2005  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  63.41 
 
 
349 aa  337  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1485  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  61.76 
 
 
354 aa  335  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130209  normal  0.405795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1200  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  60.87 
 
 
341 aa  332  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0440767  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2172  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  59.27 
 
 
355 aa  325  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00868355  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1182  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  62.45 
 
 
293 aa  324  8.000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0707578  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13950  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  59.64 
 
 
363 aa  323  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.846433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1484  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  59.06 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1915  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  58.55 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000210354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2243  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  60.73 
 
 
342 aa  315  5e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.834026  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2638  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  59.35 
 
 
316 aa  313  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16210  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  58.63 
 
 
359 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0743414  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11850  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  56.68 
 
 
354 aa  294  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00898867  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0936  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  42.31 
 
 
383 aa  247  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1601  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  44.85 
 
 
284 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0540  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase  42.48 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1587  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  44.71 
 
 
263 aa  225  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1481  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  40.16 
 
 
286 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000220785  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0905  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  42.8 
 
 
296 aa  170  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2514  SAM-dependent methyltransferase  36.23 
 
 
303 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1129  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  33.83 
 
 
281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0645  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  38.74 
 
 
266 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2376  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  38.52 
 
 
277 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1692  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  33.99 
 
 
282 aa  142  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0181  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.42 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0467  methyltransferase type 11  35.38 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2378  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  35.08 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0179  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.42 
 
 
262 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0539  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  34.14 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000466201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0069  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.24 
 
 
253 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0459  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  32.27 
 
 
277 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  35.63 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0225  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.94 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000107997  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0823  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  36.47 
 
 
254 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0358944 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0923  beta-aspartate methyltransferase  37.8 
 
 
254 aa  127  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0429  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferase-like protein  36.27 
 
 
254 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0656732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3348  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.71 
 
 
279 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0323  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  34.26 
 
 
297 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1919  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.3 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.134811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16240  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.21 
 
 
255 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1401  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  30.71 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468814  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1367  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.68 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2288  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  34.55 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00198385  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0620  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  27.82 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1298  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  27.78 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.84093  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0209  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.8 
 
 
237 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0203  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  27.82 
 
 
290 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0201025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1224  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.67 
 
 
267 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.08 
 
 
283 aa  105  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0804  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  35.57 
 
 
255 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.10576  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0690  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.31 
 
 
293 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0685  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.1 
 
 
285 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.727075  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0354  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.22 
 
 
252 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000362524  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0607  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.81 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01430  hypothetical protein  29.79 
 
 
433 aa  92.4  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00362706  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65994  translational repressor of GCN4  25.51 
 
 
362 aa  82.4  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2122  putative methyltransferase  26.87 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2535  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  27.89 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3687  predicted protein  25 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0625278  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1687  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  26.77 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1831  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  24.8 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35232  predicted protein  25.57 
 
 
385 aa  65.9  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112484  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  29.32 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0800  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.12 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1391  Methyltransferase type 12  27.57 
 
 
246 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.974092  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2751  methyltransferase small  25.42 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.64 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.811474  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1350  hypothetical protein  26.34 
 
 
244 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.656837  hitchhiker  0.0000326001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2627  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  35.04 
 
 
433 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08799  tRNA methyltransferase subunit GCD14, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09620)  24.29 
 
 
502 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.675842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2801  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  31.65 
 
 
398 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78104  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0485  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  26.51 
 
 
218 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
266 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1699  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  29.66 
 
 
210 aa  42.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase, putative  34.69 
 
 
217 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107993  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0680  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  30.91 
 
 
207 aa  42  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.393092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>